Esta clasificación hace referencia a los pacientes que intervienen en el registro, incluyendo bases de datos de imágenes y modelos.
Registro intrasujeto, es cuando las imágenes involucradas en el registro son del mismo paciente.
Registro intersujeto, es cuando las imágenes involucradas en el registro son de distintos pacientes o de un modelo y un paciente.
Atlas, es cuando las imágenes involucradas en el registro son obtenidas de un paciente y alguna base de datos.
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