Objeto

Esta clasificación es referente al objeto de estudio, es decir, a que parte del cuerpo esta dirigido el registro, Puede ser de: cabeza, tórax, abdomen, pelvis, extremidades y columna.

Sujeto

Esta clasificación hace referencia a los pacientes que intervienen en el registro, incluyendo bases de datos de imágenes y modelos.
Registro intrasujeto, es cuando las imágenes involucradas en el registro son del mismo paciente.
Registro intersujeto, es cuando las imágenes involucradas en el registro son de distintos pacientes o de un modelo y un paciente.
Atlas, es cuando las imágenes involucradas en el registro son obtenidas de un paciente y alguna base de datos.

Modalidades involucradas

Esta clasificación es según las modalidades implicadas en el registro, se distinguen las siguientes:

Monomodal, es cuando las imágenes a ser registradas pertenecen a la misma modalidad.

Multimodal, es cuando las imágenes a ser registradas no son obtenidas por la misma modalidad.

Modelo paciente, se trata de registros del paciente en varias condiciones o del registro del paciente en un modelo dado, estos registros pueden ser monomodales o multimodales.

Procedimiento de optimización

Los parámetros que componen la transformación de un registro se pueden calcular directamente, es decir, determinar de una manera explícita con los datos disponibles ó buscar, es decir, determinar al encontrar un óptimo de una función definida en el espacio de parámetros.
En el primer caso, este parámetro esta completamente determinado, usualmente con métodos matemáticos.
En los casos en los cuales el parámetro proviene de un máximo o mínimo de alguna función lo que se busca es que dicha función cuantifique la similitud entre ambas imágenes.